Dalam melakukan riset, penelitian dan berbagai programnya, PusDeK UIN Mataram berpegang pada prinsip-prinsip sebagai berikut:

1. Memanfaatkan teori termutakhir dalam ilmu-ilmu sosial untuk melihat masalah-masalah tertentu di Indonesia.

2. Melihat berbagai variasi dalam kasus-kasus yang dipelajari. Sehingga dapat mengambil pelajaran dari kasus-kasus tersebut guna melakukan peningkatan kualitas demokrasi dan pelayanan publik.

3. Riset dan advokasi saling terkait. Advokasi yang kuat hanya bisa dilakukan berdasarkan hasil riset yang bisa dipertanggungjawabkan secara metode dan data.

4. Riset dan advokasi harus mengandalkan media sosial dan fakta-fakta eperis yang perannya makin penting.

5. Terus melakukan publikasi dan deseminasi terhadap hasil kajian dan penelitian yang dilakukan.